服务器操作系统有：Windows Server系统、Netware系统、Unix系统、Linux系统。
Windows Server系统：
1）优点：Windows Server系统相对于其他服务器系统而言，极其易用，极大降低使用者的学习成本。
2）缺点：Windows Server系统对服务器硬件要求较高、稳定性不是很好。
3）应用：Windows Server系统适用于中、低档服务器中。

Netware系统
1）优点：Netware系统具有优秀的批量处理功能和安全、稳定的系统性能，且兼容DOS命令，支持丰富的应用软件，对无盘站和游戏有着较好的支持，对网络硬件要求较低。
2）缺点：Netware系统操作大部分依靠手工命令实现，不够人性化；对硬盘识别最高只能达到1G，无法满足TB级数据的存储
3）应用：Netware系统适用于低档服务器，常运用在中小型企业、学校、游戏厅。

Unix系统：
1）优点：Unix系统支持大型文件系统服务、数据服务应用，功能强大、稳定性和安全性能好。
2）缺点：Unix系统操作主要以命令的方式进行，不容易掌握。
3）应用：大型网站或是大型企、事业局域网中。

Linux系统：
1）优点：Linux系统是开源系统，受到所有开发者的共同监督，已经是非常成熟的服务器系统，并且拥有着一套完整的权限机制，安全性与稳定性都很高。
2）缺点：Linux系统操作需要一定时间的学习。
3）应用：Linux系统适用于中、高档服务器中。

由于Unix系统结构不合理、NetWare系统不够人性化，大部分企业都是Windows Server系统、Linux系统两种服务器系统中做取舍。